В пятой книге «Истории правления Филиппа II» описывается война с морисками с 1566 по 1571 год, а также война с турками с 1570 по 1574 год. Успехи христианской коалиции в войне против Оттоманской империи, победа в битве при Лепанто нанесли сильный удар по могуществу турок и оказали влияние на всю дальнейшую историю Европы, как, впрочем, и России.

В незаконченной шестой книге автор касается внутренних дел Испании при Филиппе, его отношений с видными представителями кастильской знати, кортесами и духовенством, а также тридцатилетнего строительства Эскориала как одного из важнейших архитектурных проектов XVI века.