Marvel’s Spider-Man 2 — это однопользовательская игра с открытым миром, в которой пользователи управляют двумя протагонистами — Питером Паркером и Майлзом Моралесом. Оба персонажа передвигаются по открытому миру в городе Нью-Йорк и противостоят различным преступникам. Игроки могут приобрести дополнительные способности и костюмы Человека-паука, и есть возможность переключаться между протагонистами во время свободного перемещения по открытому миру. Однако у каждого из Людей-пауков есть собственные сюжетные и побочные миссии.
Сохраняя боевую систему из предыдущих частей, игра также вносит новшества в виде новых костюмов и способностей. Новые костюмы Питера и Майлза оснащены паутинными крыльями, позволяющими им парить по городу